酶制劑的種類很多，但在印染中應用的主要是水解酶，如淀粉酶、纖維素酶、蛋白酶、脂肪酶、果膠酶等。也有少量的氧化還原酶如過氧化氫酶、漆酶和轉移酶如谷氨酰胺轉胺酶。
酶制劑在印染中的應用主要在前處理，主要是去除纖維上的天然雜質和附加雜質如漿料等，其次是用于后整理，主要是對纖維表面的處理。
酶制劑在印染中的應用有些方面非常成熟，如淀粉酶退漿、纖維素織物生物拋光、牛仔服酶洗、真絲脫膠等；有些方面盡管研究了很多年，但不很成熟，還需做大量工作，如棉織物的煮練、漂白等；有些方面還未開發或很不成熟，而且近期內難以突破。
另外，目前酶制劑的應用主要集中在對天然纖維(包括再生纖維素纖維的處理上)，而對合成纖維的處理還很不成熟。
主要原因在于：
1、天然纖維，包括天然纖維上的各類雜質已在自然界中長期存在，已有相應的酶能對其作用。而合成聚合物，如合成纖維、聚乙烯醇等在自然界出現的時間不長，以及其本身結構等原因，還沒有相應的、合適的酶能對其作用。
2、酶制劑具有很強的專一性，一般來說，一種酶只能分解一種或一類物質，而天然纖維除了纖維本身外，還含有多種雜質，只靠一種酶是不能將其全部分解的，必須要多種酶配合起來。但不同的酶的共適條件不同，這樣會影響酶的協同作用效果。
3、目前商品化的酶制劑的品種還不多，纖維上的許多雜質還缺乏相應的商品酶對其進行分解，如分解聚乙烯醇的PVA酶、木質素酶、半纖維素酶都還沒有商品化。另外有些成分的雜質如棉蠟(主要成分是高碳數的碳氫化合物)到目前還沒有相應的酶能對其進行分解。
4、酶制劑與纖維的作用屬于液-固相作用，另外酶也屬于高分子物質，分子量很高，很難滲透到纖維內，只能在纖維表面起作用，這樣會影響到其作用效率。